Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NOMO3P69849 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms