Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms