Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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