Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms