Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms