Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTAP49354 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms