Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms