Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXD12P35452 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXD12P35452 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXD12P35452 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXD12P35452 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXD12P35452 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXD12P35452 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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