Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF4P34130 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF4P34130 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms