Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms