Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCAP28676 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCAP28676 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCAP28676 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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