Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms