Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRCP23327 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HRCP23327 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRCP23327 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRCP23327 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRCP23327 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRCP23327 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRCP23327 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HRCP23327 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HRCP23327 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HRCP23327 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HRCP23327 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HRCP23327 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HRCP23327 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRCP23327 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRCP23327 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms