Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms