Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms