Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHP20396 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHP20396 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHP20396 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRHP20396 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TRHP20396 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRHP20396 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms