Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms