Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms