Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFTRP13569 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFTRP13569 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFTRP13569 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFTRP13569 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFTRP13569 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFTRP13569 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFTRP13569 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFTRP13569 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFTRP13569 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms