Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL2P13500 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL2P13500 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL2P13500 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL2P13500 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL2P13500 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL2P13500 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL2P13500 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL2P13500 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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