Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ACAA1P09110 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms