Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOP08100 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOP08100 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms