Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms