Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSL4O60488 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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