Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL3O43909 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms