Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CALUO43852 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALUO43852 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms