Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCF2LO15068 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms