Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MCRIP1C9JLW8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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