Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ODF3BA8MYP8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ODF3BA8MYP8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ODF3BA8MYP8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ODF3BA8MYP8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3BA8MYP8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms