Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms