Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms