Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms