Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms