Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms