Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms