Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms