Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms