Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms