Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYCBPQ99417 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms