Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms