Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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