Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms