Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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