Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms