Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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