Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP3Q96DZ5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP3Q96DZ5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP3Q96DZ5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP3Q96DZ5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP3Q96DZ5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP3Q96DZ5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLIP3Q96DZ5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLIP3Q96DZ5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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