Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms