Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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