Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT35Q92764 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms