Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms